Secara administratif desa Wonoharjo masuk dalam wilayah Kecamatan Pangandaran Kabupaten Pangandaran Provinsi Jawa barat, tipologi desa masuk dalam kategori desa pantai/ pesisir. Adapun batas – batas wilayah desa Wonoharjo yaitu sebelah timur  berbatasan dengan desa Pananjung, sebelah barat berbatasan dengan desa Cikembulan, sebelah selatan berbatasan dengan desa Sidomulyo dan desa Sidamulih sebelah selatan berbatasan dengan samudra Indonesia. Orbitasi pusat pemerintahan desa berjarak 2 km dari Kantor Kecamatan, 91 km dari kantor Bupati dan 218 km dari kantor gubernur. Luas wilayah desa  616 Ha/ 5.1 km 2,  terdiri tanah sawah 171 Ha, tanah kering/ pemukiman 278 Ha, PT Star Trust tanah ex perkebunan 167 ha.

Secara klimatologi desa wonoharjo memiliki curah huja 19.2 mm/ 10 tahun, jumlah bulan hujan 6 bulan, suhu rata-rata harian 28 ^o C, tinggi tempat 7 m diatas permukaan laut dngan bentang wilayah datar. Batas-batas administratif pemerintahan Desa Wonoharjo Kecamatan Pangandaran sebagai berikut :

Dilihat dari topografi dan kontur tanah, Desa Wonoharjo Kecamatan Pangandaran secara umum berupa dataran yang berada pada ketinggian antara 10 M s/d 20 M  di atas permukaan laut dengan suhu rata-rata berkisar antara 29⁰ s/d 30⁰ Celcius. Desa Wonoharjo terdiri dari 3 ( Tiga ) Dusun, 20 ( dua puluh ) RW dan 49 ( Empat Puluh Sembilan ) RT. Tiga Dusun tersebut yaitu Dusun Kedungrejo, Dusun Wonoharjo, dan Dusun Padasuka. 2. Orbitasi dan waktu tempuh dari ibukota kecamatan 0,05 km² dengan waktu tempuh 2 menit dan dari ibukota kabupaten 20 km² dengan waktu tempuh 1 jam.

Peta Desa: